CCL:G: Using downloaded basis set



Is there a blank line between the basis specification and the ECP specification?

--David Shobe


On Mon, Jul 22, 2019, 1:49 PM Nikiwe Mhlanga mhlanga.nikiwe.:.gmail.com <owner-chemistry "-at-" ccl.net> wrote:
Dear CCL subscribers,

We are using Gaussian to calculate vibrational frequencies of a 4-mercaptobenzoic acid molecule adsorbed on an Ag cluster.  For the Ag atoms, we are attempting to use   (aug-cc-pvdz-pp)  basis set downloaded from https://www.basissetexchange.org/ .  We followed the CCL link (http://www.ccl.net/cgi-bin/ccl/message-new?2012+07+28+005) on how to incorporate basis set that is not integrated on Gaussian into the input file yet we are still getting errors and we think the issue is the syntax. We have used PBEPBE/Gen,  PBEPBE/GenECP,  PBEPBE/Gen/GenECP, pbepbe/Gen Pseudo=Read, yet we still have the same error.

The error:

Rotational constants (GHZ):           0.0116418           0.0088528           0.0088244

 General basis read from cards:  (5D, 7F)
 QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
 Ag-ECP 4 28
 '
 Last state= "Top"
 TCursr=      2832 LCursr=         0
 Error reading general basis specification.
 Error termination via Lnk1e in /apps/chpc/chem/gaussian16/B01/g16/l301.exe at Mon Jul 22 12:48:08 2019.
 Job cpu time:       0 days  0 hours  0 minutes  0.8 seconds.
 Elapsed time:       0 days  0 hours  0 minutes  1.3 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=    126 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1


Our input file


 %chk=Ag36_MBA1.chk

%mem = 5GB
%lindaworkers=cnode0930.cm.cluster,cnode0706.cm.cluster
# opt=(calcfc,tight) freq=raman pbepbe/Gen Pseudo=Read pop=(nbo,savenbo,full)
geom=connectivity int=ultrafine

Chemisorption of 4-MBA via the COO-end on Ag36

0 2
 Ag                 0.02080000    0.02080000    0.02080000
 Ag                -4.04650000   -2.04290000   -6.04120000
 Ag                -2.04290000   -4.04650000   -6.04120000
 Ag                -0.03920000   -2.04290000   -6.04120000
 Ag                -2.04290000   -0.03920000   -6.04120000
 Ag                -4.04650000   -6.04120000   -2.04290000
 Ag                -2.04290000   -6.04120000   -4.04650000
 Ag                -0.03920000   -6.04120000   -2.04290000
 Ag                -6.04120000   -4.04650000   -2.04290000
 Ag                -6.04120000   -2.04290000   -4.04650000
 Ag                -4.10650000   -4.10650000   -4.10650000
 Ag                -4.05460000   -2.04290000   -2.04290000
 Ag                -2.04290000   -4.05460000   -2.04290000
 Ag                -2.04290000   -2.04290000   -4.05460000
 Ag                 0.02080000   -4.10650000   -4.10650000
 Ag                -0.03110000   -2.04290000   -2.04290000
 Ag                 1.95550000   -4.04650000   -2.04290000
 Ag                 1.95550000   -2.04290000   -4.04650000
 Ag                -6.04120000   -0.03920000   -2.04290000
 Ag                -4.10650000    0.02080000   -4.10650000
 Ag                -4.04650000    1.95550000   -2.04290000
 Ag                -2.04290000   -0.03110000   -2.04290000
 Ag                -2.04290000    1.95550000   -4.04650000
 Ag                 0.02080000    0.02080000   -4.10650000
 Ag                -0.03920000    1.95550000   -2.04290000
 Ag                 1.95550000   -0.03920000   -2.04290000
 Ag                -2.04290000   -6.04120000   -0.03920000
 Ag                -6.04120000   -2.04290000   -0.03920000
 Ag                -4.10650000   -4.10650000    0.02080000
 Ag                -4.04650000   -2.04290000    1.95550000
 Ag                -2.04290000   -4.04650000    1.95550000
 Ag                -2.04290000   -2.04290000   -0.03110000
 Ag                 0.02080000   -4.10650000    0.02080000
 Ag                -0.03920000   -2.04290000    1.95550000
 Ag                 1.95550000   -2.04290000   -0.03920000
 Ag                -4.10650000    0.02080000    0.02080000
 Ag                -2.04290000   -0.03920000    1.95550000
 Ag                -2.04290000    1.95550000   -0.03920000
 H                  3.45570000   -6.32640000   -6.41100000
 C                  1.63830000   -6.35540000   -7.86760000
 C                  0.72800000   -5.53590000   -6.93410000
 C                  1.12390000   -6.84060000   -9.23440000
 H                  0.06810000   -6.57660000   -9.57280000
 C                  2.03760000   -7.68340000  -10.14370000
 H                  1.65660000   -8.04450000  -11.15650000
 C                  3.46420000   -8.04250000   -9.68580000
 S                  4.53570000   -9.03450000  -10.75550000
 C                  3.98460000   -7.54160000   -8.32590000
 H                  5.04340000   -7.79810000   -7.99050000
 C                  3.07180000   -6.69720000   -7.41840000
 H                  3.96650000   -9.12270000  -12.04230000
 O                  1.28930000   -5.08040000   -5.60930000
 O                 -0.69730000   -5.21340000   -7.34220000

 1 16 1.0 22 1.0 25 1.0 26 1.0 32 1.0 34 1.0 35 1.0 37 1.0 38 1.0
 2 3 1.0 5 1.0 10 1.0 11 1.0 14 1.0 20 1.0
 3 4 1.0 7 1.0 11 1.0 14 1.0 15 1.0 53 1.0
 4 5 1.0 14 1.0 15 1.0 18 1.0 24 1.0
 5 14 1.0 20 1.0 23 1.0 24 1.0
 6 7 1.0 9 1.0 11 1.0 13 1.0 27 1.0 29 1.0
 7 8 1.0 11 1.0 13 1.0 15 1.0
 8 13 1.0 15 1.0 17 1.0 27 1.0 33 1.0
 9 10 1.0 11 1.0 12 1.0 28 1.0 29 1.0
 10 11 1.0 12 1.0 19 1.0 20 1.0
 11 12 1.0 13 1.0 14 1.0
 12 13 1.0 14 1.0 19 1.0 20 1.0 22 1.0 28 1.0 29 1.0 32 1.0 36 1.0
 13 14 1.0 15 1.0 16 1.0 27 1.0 29 1.0 32 1.0 33 1.0
 14 15 1.0 16 1.0 20 1.0 22 1.0 24 1.0
 15 16 1.0 17 1.0 18 1.0 52 1.0
 16 17 1.0 18 1.0 22 1.0 24 1.0 26 1.0 32 1.0 33 1.0 35 1.0
 17 18 1.0 33 1.0 35 1.0
 18 24 1.0 26 1.0
 19 20 1.0 21 1.0 28 1.0 36 1.0
 20 21 1.0 22 1.0 23 1.0
 21 22 1.0 23 1.0 36 1.0 38 1.0
 22 23 1.0 24 1.0 25 1.0 32 1.0 36 1.0 37 1.0 38 1.0
 23 24 1.0 25 1.0
 24 25 1.0 26 1.0
 25 26 1.0 38 1.0
 26 35 1.0
 27 29 1.0 31 1.0 33 1.0
 28 29 1.0 30 1.0 36 1.0
 29 30 1.0 31 1.0 32 1.0
 30 31 1.0 32 1.0 36 1.0 37 1.0
 31 32 1.0 33 1.0 34 1.0
 32 33 1.0 34 1.0 36 1.0 37 1.0
 33 34 1.0 35 1.0
 34 35 1.0 37 1.0
 35
 36 37 1.0 38 1.0
 37 38 1.0
 38
 39 50 1.0
 40 42 1.0 50 2.0 41 1.0
 41 52 1.5 53 1.5
 42 44 2.0 43 1.0
 43
 44 46 1.0 45 1.0
 45
 46 48 2.0 47 1.0
 47 51 1.0
 48 50 1.0 49 1.0
 49
 50
 51
 52
 53

H C S O 0
aug-cc-pvdz
****
Ag     0
S   8   1.00
    180.0750000              0.0008490
     21.8987000             -0.0654500
     13.8670000              0.2977650
      6.1426300             -0.7531210
      1.4381400              0.8811750
      0.6483820              0.4351760
      0.1288820              0.0147380
      0.0457380             -0.0013990
S   8   1.00
    180.0750000             -0.0002030
     21.8987000              0.0157230
     13.8670000             -0.0792290
      6.1426300              0.2226340
      1.4381400             -0.3491960
      0.6483820             -0.2559780
      0.1288820              0.5486660
      0.0457380              0.6181030
S   8   1.00
    180.0750000             -0.0008620
     21.8987000              0.0525460
     13.8670000             -0.2081000
      6.1426300              0.5249720
      1.4381400             -1.2701730
      0.6483820              0.5393730
      0.1288820              1.6533910
      0.0457380             -1.5839750
S   1   1.00
      0.0457380              1.0000000
S   1   1.00
      0.0162000              1.0000000
P   7   1.00
     11.8751000              0.1162480
      8.0024500             -0.3072860
      2.0176600              0.5157360
      0.9542300              0.5031040
      0.4231180              0.1420950
      0.1358850              0.0051530
      0.0454010              0.0001040
P   7   1.00
     11.8751000             -0.0282840
      8.0024500              0.0783470
      2.0176600             -0.1567410
      0.9542300             -0.1886250
      0.4231180              0.0635650
      0.1358850              0.5817780
      0.0454010              0.4999110
P   7   1.00
     11.8751000             -0.0528570
      8.0024500              0.1470390
      2.0176600             -0.3129730
      0.9542300             -0.3708280
      0.4231180              0.4236290
      0.1358850              0.7536550
      0.0454010              0.0708700
P   1   1.00
      0.0454010              1.0000000
P   1   1.00
      0.0152000              1.0000000
D   6   1.00
     26.4320000              0.0034790
     11.0345000             -0.0138480
      2.7378700              0.2545990
      1.1957500              0.4498490
      0.4820420              0.3757380
      0.1729080              0.1458790
D   6   1.00
     26.4320000             -0.0047330
     11.0345000              0.0190700
      2.7378700             -0.4332980
      1.1957500             -0.4445680
      0.4820420              0.4914420
      0.1729080              0.5728660
D   1   1.00
      0.1729080              1.0000000
D   1   1.00
      0.0620000              1.0000000
F   1   1.00
      1.3299000              1.0000000
F   1   1.00
      0.4449000              1.0000000
****
Ag     0
Ag-ECP     4     28
g potential
  1
2      1.0000000              0.0000000
s-g potential
  2
2     12.5677140            255.0547710
2      6.9976620             36.9833930
p-g potential
  4
2     11.3164960             60.7157050
2     10.9580630            121.4438890
2      7.1114000             10.1718660
2      6.7733190             20.4865640
d-g potential
  4
2      8.9284370             29.5049380
2     11.1025670             44.0187360
2      5.5432120              5.3683330
2      3.9288350              7.4083750
f-g potential
  2
2     11.0129130            -12.6234030
2     11.0198980            -16.7643270


Your help will be appreciated.


Kind regards

Nikiwe Mhlanga

Scientist

Mintek

Randburg

South Africa